MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio harveyi ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 61871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009783	CGT	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156972383
2	NC_009783	TCT	3	9	2095	2103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972383
3	NC_009783	GTA	2	6	2202	2207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972383
4	NC_009783	TTA	2	6	2218	2223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156972383
5	NC_009783	TCG	2	6	2355	2360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156972383
6	NC_009783	TTG	2	6	2383	2388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156972383
7	NC_009783	CTT	2	6	2438	2443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972383
8	NC_009783	CTTT	2	8	2455	2462	0 %	75 %	0 %	25 %	156972383
9	NC_009783	TGT	2	6	2578	2583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156972383
10	NC_009783	CT	4	8	2672	2679	0 %	50 %	0 %	50 %	156972383
11	NC_009783	GGA	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156972383
12	NC_009783	CTT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972384
13	NC_009783	CTT	2	6	2868	2873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972384
14	NC_009783	CAG	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972384
15	NC_009783	CCA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972384
16	NC_009783	TCT	2	6	2912	2917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972384
17	NC_009783	ACC	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972384
18	NC_009783	ACC	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972384
19	NC_009783	TCT	2	6	3092	3097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972384
20	NC_009783	AGGA	2	8	3148	3155	50 %	0 %	50 %	0 %	156972384
21	NC_009783	CA	3	6	3199	3204	50 %	0 %	0 %	50 %	156972384
22	NC_009783	TCT	2	6	3267	3272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972384
23	NC_009783	CAA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972384
24	NC_009783	GAC	2	6	3408	3413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972384
25	NC_009783	GGT	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156972384
26	NC_009783	CAACC	2	10	3459	3468	40 %	0 %	0 %	60 %	156972384
27	NC_009783	CAC	2	6	3477	3482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972384
28	NC_009783	GTT	2	6	3632	3637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156972384
29	NC_009783	CAG	3	9	3642	3650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972384
30	NC_009783	CCA	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972384
31	NC_009783	ACCA	2	8	3763	3770	50 %	0 %	0 %	50 %	156972384
32	NC_009783	TACGTC	2	12	3817	3828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	156972384
33	NC_009783	AGT	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972384
34	NC_009783	TCT	2	6	3899	3904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972384
35	NC_009783	GTA	2	6	3963	3968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972384
36	NC_009783	TCT	2	6	3981	3986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972384
37	NC_009783	CTT	2	6	4002	4007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972384
38	NC_009783	GTG	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156972384
39	NC_009783	AGT	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972384
40	NC_009783	ATG	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972384
41	NC_009783	TGCG	2	8	4254	4261	0 %	25 %	50 %	25 %	156972384
42	NC_009783	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156972384
43	NC_009783	CCA	2	6	4382	4387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972384
44	NC_009783	CACCT	2	10	4477	4486	20 %	20 %	0 %	60 %	156972384
45	NC_009783	CTT	2	6	4491	4496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972384
46	NC_009783	TTG	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156972384
47	NC_009783	CTT	2	6	4583	4588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972385
48	NC_009783	TTG	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156972385
49	NC_009783	CAC	2	6	4664	4669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972385
50	NC_009783	AAC	2	6	4867	4872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972385
51	NC_009783	ATG	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972385
52	NC_009783	GT	3	6	4964	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	156972385
53	NC_009783	TTG	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156972385
54	NC_009783	CAA	2	6	5006	5011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972385
55	NC_009783	CTTCA	2	10	5016	5025	20 %	40 %	0 %	40 %	156972385
56	NC_009783	CTT	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972385
57	NC_009783	GA	3	6	5045	5050	50 %	0 %	50 %	0 %	156972385
58	NC_009783	TCA	2	6	5080	5085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156972385
59	NC_009783	CTT	2	6	5123	5128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972385
60	NC_009783	CGA	2	6	5179	5184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972385
61	NC_009783	TTC	2	6	5199	5204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972385
62	NC_009783	TCT	3	9	5219	5227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972385
63	NC_009783	TGC	2	6	5256	5261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156972385
64	NC_009783	AG	3	6	5433	5438	50 %	0 %	50 %	0 %	156972385
65	NC_009783	TTAA	2	8	5446	5453	50 %	50 %	0 %	0 %	156972385
66	NC_009783	AGC	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972385
67	NC_009783	GAA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156972385
68	NC_009783	CTT	2	6	5705	5710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972385
69	NC_009783	GCTT	2	8	5725	5732	0 %	50 %	25 %	25 %	156972385
70	NC_009783	GCA	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972385
71	NC_009783	CAAT	2	8	5770	5777	50 %	25 %	0 %	25 %	156972385
72	NC_009783	CGAT	2	8	5779	5786	25 %	25 %	25 %	25 %	156972385
73	NC_009783	AAGT	2	8	5812	5819	50 %	25 %	25 %	0 %	156972385
74	NC_009783	AGA	2	6	5843	5848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156972385
75	NC_009783	CTTCAC	2	12	5957	5968	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	156972385
76	NC_009783	CTT	2	6	6071	6076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972385
77	NC_009783	ATG	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972385
78	NC_009783	CTG	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156972385
79	NC_009783	GCA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972385
80	NC_009783	GCC	2	6	6193	6198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156972385
81	NC_009783	TTGG	2	8	6203	6210	0 %	50 %	50 %	0 %	156972385
82	NC_009783	GAGT	2	8	6285	6292	25 %	25 %	50 %	0 %	156972385
83	NC_009783	TGG	2	6	6324	6329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156972385
84	NC_009783	ACC	2	6	6333	6338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972385
85	NC_009783	ATT	2	6	6345	6350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156972385
86	NC_009783	ATTC	2	8	6377	6384	25 %	50 %	0 %	25 %	156972385
87	NC_009783	TTG	2	6	6537	6542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156972386
88	NC_009783	TCA	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156972386
89	NC_009783	CTGT	2	8	6610	6617	0 %	50 %	25 %	25 %	156972386
90	NC_009783	ACAA	2	8	6621	6628	75 %	0 %	0 %	25 %	156972386
91	NC_009783	CAA	2	6	6653	6658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972386
92	NC_009783	TCC	2	6	6663	6668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156972386
93	NC_009783	TTGAA	2	10	6672	6681	40 %	40 %	20 %	0 %	156972386
94	NC_009783	GAT	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156972386
95	NC_009783	CTA	2	6	6698	6703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156972386
96	NC_009783	AGAA	2	8	6898	6905	75 %	0 %	25 %	0 %	156972387
97	NC_009783	CAA	2	6	6916	6921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972387
98	NC_009783	TTC	2	6	6968	6973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972387
99	NC_009783	ATCA	2	8	6983	6990	50 %	25 %	0 %	25 %	156972387
100	NC_009783	CCA	2	6	6999	7004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972387
101	NC_009783	TCA	2	6	7170	7175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156972387
102	NC_009783	TAA	2	6	7284	7289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156972387
103	NC_009783	GC	3	6	7349	7354	0 %	0 %	50 %	50 %	156972387
104	NC_009783	GCA	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972387
105	NC_009783	TAA	2	6	7392	7397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156972387
106	NC_009783	TCT	2	6	7418	7423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972387
107	NC_009783	TTCA	2	8	7427	7434	25 %	50 %	0 %	25 %	156972387
108	NC_009783	AGA	2	6	7481	7486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156972387
109	NC_009783	CGA	2	6	7682	7687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972388
110	NC_009783	A	6	6	7695	7700	100 %	0 %	0 %	0 %	156972388
111	NC_009783	CCA	2	6	7754	7759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972388
112	NC_009783	CAA	2	6	7764	7769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972388
113	NC_009783	GCA	2	6	8082	8087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972389
114	NC_009783	GAC	2	6	8130	8135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156972389
115	NC_009783	CAA	2	6	8247	8252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972389
116	NC_009783	CAA	2	6	8311	8316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972389
117	NC_009783	ATC	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156972389
118	NC_009783	TAA	2	6	8389	8394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156972389
119	NC_009783	CAC	2	6	8400	8405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972389
120	NC_009783	TCTT	2	8	8435	8442	0 %	75 %	0 %	25 %	156972389
121	NC_009783	TGG	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156972389
122	NC_009783	CGTG	2	8	8522	8529	0 %	25 %	50 %	25 %	156972389
123	NC_009783	CGC	2	6	8662	8667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156972389
124	NC_009783	CTG	2	6	8811	8816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156972389
125	NC_009783	ACC	2	6	8824	8829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972389
126	NC_009783	CTT	2	6	8853	8858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156972389
127	NC_009783	ATGA	2	8	8887	8894	50 %	25 %	25 %	0 %	156972389
128	NC_009783	ACA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972389
129	NC_009783	CAA	2	6	9326	9331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156972390
130	NC_009783	CGC	2	6	9380	9385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156972390
131	NC_009783	CGC	2	6	9421	9426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156972390
132	NC_009783	AG	3	6	9462	9467	50 %	0 %	50 %	0 %	156972390
133	NC_009783	ACC	2	6	9483	9488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156972390
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